自然補償器的補償原理可以概括為“自然修復(fù)和再生”，具體包括以下幾個方面：

生態(tài)系統(tǒng)修復(fù)：自然補償器通過利用自然生態(tài)系統(tǒng)的自我修復(fù)能力，恢復(fù)和改善受損的生態(tài)系統(tǒng)。例如，通過植被修復(fù)、濕地恢復(fù)等方式，提高土壤質(zhì)量、減少土地侵蝕等，從而促進生態(tài)系統(tǒng)的修復(fù)和生態(tài)過程的恢復(fù)。

生態(tài)系統(tǒng)再生：自然補償器通過促進自然生態(tài)系統(tǒng)的再生能力，實現(xiàn)受損生態(tài)系統(tǒng)的再生和生態(tài)過程的重建。例如，通過植被恢復(fù)、濕地恢復(fù)等方式，增加生境、提高生境質(zhì)量，從而促進物種的繁衍和遷移，實現(xiàn)生態(tài)系統(tǒng)的再生。

生態(tài)系統(tǒng)管理：自然補償器通過對生態(tài)系統(tǒng)進行管理和保護，維護生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)的穩(wěn)定性和可持續(xù)性。例如，通過生態(tài)保護區(qū)劃定、規(guī)劃和管理、生態(tài)系統(tǒng)管理計劃制定和實施等方式，保護和管理生態(tài)系統(tǒng)，維護生態(tài)系統(tǒng)的服務(wù)功能。

總體而言，自然補償器的補償原理是利用自然生態(tài)系統(tǒng)的自我修復(fù)和再生能力，通過生態(tài)系統(tǒng)修復(fù)、生態(tài)系統(tǒng)再生和生態(tài)系統(tǒng)管理等多種手段，實現(xiàn)受損生態(tài)系統(tǒng)的修復(fù)和保護，維護和提高生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)的質(zhì)量和可持續(xù)性。