自然補償器是一種基于生態系統服務理論的環境修復方法，其作用原理主要包括以下幾個方面：

生態系統服務的恢復和改善：自然補償器通過采取適當的措施和方法，例如植樹造林、濕地恢復、野生動植物保護等，恢復或改善生態系統服務，例如提供木材、凈化空氣、保護水源、維護生物多樣性、保護棲息地等。這些生態系統服務的恢復和改善可以彌補因人類活動而導致的生態系統服務的損失或降低。

生態系統功能的提升：自然補償器可以通過生態系統功能的提升，增強生態系統對人類活動的適應能力和抵抗能力，例如增加植被覆蓋率、提高土壤肥力、增加水源涵養等。

碳匯和氣候調節：自然補償器可以通過增加植被、恢復濕地等方式，將大氣中的二氧化碳固定在生物體內，形成碳匯，減緩氣候變化的影響。

生態系統的可持續利用：自然補償器可以通過生物多樣性保護、土地保育等方式，促進生態系統的可持續利用，提高生態系統服務的穩定性和持續性。

總的來說，自然補償器的作用原理是通過恢復或改善生態系統服務，提升生態系統功能，形成碳匯和氣候調節，以及促進生態系統的可持續利用，實現環境修復和生態系統管理的目的。