套管補償器和波紋補償器都是用于管道連接處補償熱膨脹和振動引起的變形的裝置，但它們的結構和工作原理有所不同，主要區別如下：

結構不同：套管補償器由內外套管、波紋管、法蘭等組成；波紋補償器由波紋管、法蘭等組成。

補償量不同：套管補償器的補償量相對較小，適用于一些小直徑、低溫、低壓、低振動的管道連接處；波紋補償器的補償量相對較大，適用于一些大直徑、高溫、高壓、高振動的管道連接處。

應用場合不同：由于補償量和結構不同，套管補償器適用于一些小型低溫低壓管道，如給水、排水、空調等系統；波紋補償器適用于一些大型高溫高壓管道，如石油、化工、電力、供暖等系統。

安裝方式不同：由于結構的不同，套管補償器和波紋補償器的安裝方式也有所不同。套管補償器多采用法蘭連接或焊接連接；波紋補償器多采用法蘭連接或卡箍連接。

綜上所述，套管補償器和波紋補償器在結構、補償量、應用場合和安裝方式等方面都有所不同，應在實際應用中根據管道的不同情況選擇適合的補償器。